在這篇文章中,公布了國際大麥測序聯(lián)盟(IBSC)在大麥基因組精細(xì)圖譜研究上取得的重大研究成果,《自然》雜志同時還刊登了題為“基因組學(xué):大麥基因組破解”的雜志社專題特別報道。
大麥?zhǔn)侨虻谒拇蠛坦阮愖魑?,被人類馴化了已經(jīng)有一萬年。它既是糧食和飼料,也是生產(chǎn)啤酒的重要原料。
“在我國,大麥栽培面積曾經(jīng)達(dá)一億畝以上,是非常重要的農(nóng)作物。”張國平教授告訴記者,“在浙江,也曾經(jīng)有600萬畝栽培面積??梢哉f,浙江很適合栽培大麥,特別是啤用大麥。”
不過,破解大麥基因組卻是一件極其困難的工程。
“因?yàn)榇篼溁蚪M全長5.1Gb,是水稻基因組的11倍,含有3.9萬多個蛋白編碼基因,且有大量多拷貝基因,形成復(fù)雜的基因家族,并富含轉(zhuǎn)座因子。”
通俗地講,這是一個巨長無比的基因迷宮,且在人類一萬年的種植過程中不斷變異。而大麥遺傳與育種研究要取得突破性成果,高質(zhì)量的大麥基因組參考序列是必不可少的。
因此,基因組測序的研究成果一發(fā)表,就登上了《自然》雜志封面。
為了這個成果,國際大麥測序聯(lián)盟(IBSC)耗費(fèi)了近10年時間,綜合運(yùn)用包括染色體構(gòu)象作圖和生物納米作圖等多種最先進(jìn)的測序和組裝技術(shù),利用約2.5Tb大麥基因組測序數(shù)據(jù),組裝完成了一個包含4.79Gb的大麥高質(zhì)量參考基因組序列,每條染色體均被排成一個線性分子,其中94.8%的組裝序列明確定位在大麥各條染色體上。
浙江大學(xué)張國平教授團(tuán)隊(duì)與澳大利亞李承道教授團(tuán)隊(duì)共同對他們長期關(guān)注的大麥麥芽品質(zhì)相關(guān)基因進(jìn)行了深入分析,明確了大麥麥芽品質(zhì)相關(guān)基因的結(jié)構(gòu)變異,為高品質(zhì)大麥育種指明了方向。
這項(xiàng)工作,對大麥種質(zhì)資源利用及相關(guān)基因的克隆和鑒定工作都具有重要意義。雖然基因測序是高科技的研究,但這項(xiàng)成果對普羅大眾的生活也有不小的影響。
“雖然我們已很少直接吃大麥了,但其實(shí)大麥作為糧食,對保健是很有好處的。”張國平告訴記者,“因?yàn)榇篼溊镉幸环N成分叫β-葡聚糖,它對治療食道癌、降血脂都有療效。它對減肥也有用,日本還流行喝大麥茶。”
那么基因測序成果在這些生活領(lǐng)域會有什么作用呢?
“本來,大麥的品質(zhì)是很復(fù)雜的。我們完成了基因測序,就能有效控制大麥基因的表達(dá),有利于定向改良基因。”張國平教授說。
例如,β-葡聚糖對制造啤酒和飼料來說,并不是一個好成分。“我們可以通過基因改良把它減少。但對于人體保健而言,β-葡聚糖卻是很好的物質(zhì)。如市場上在銷售的麥綠素,就是由大麥的嫩葉做原材料的。那么,我們可以根據(jù)大麥用途,定向控制β-葡聚糖含量。”
“再比如,很多人喜歡喝冰啤酒,但是啤酒經(jīng)冷藏后可能會出現(xiàn)渾濁、沉淀的東西。我們發(fā)現(xiàn),這種渾濁跟某種蛋白有關(guān),那么如果能控制這種蛋白,啤酒的品質(zhì)就會提高。”
在國家自然科學(xué)基金重點(diǎn)項(xiàng)目和國際合作等項(xiàng)目資助下,張國平教授團(tuán)隊(duì)在大麥基因組起源進(jìn)化領(lǐng)域取得過一系列重大突破。
此前,張教授的團(tuán)隊(duì)證明“我國青藏高原及其周邊地區(qū)是世界栽培大麥的一個重要進(jìn)化和起源中心”和明確“現(xiàn)代栽培大麥基因組源于中東肥沃月灣和我國青藏高原地區(qū)的野生大麥,兩地野生大麥基因組對現(xiàn)代栽培大麥基因組的貢獻(xiàn)大致相當(dāng),但存在明顯的染色體及其片段上的差異”。
現(xiàn)在,張教授的團(tuán)隊(duì)明確了大麥麥芽品質(zhì)相關(guān)基因的結(jié)構(gòu)變異,對我國大麥,尤其是西藏野生大麥研究工作又做出了重要貢獻(xiàn),顯著提升我國大麥研究的整體水平和在國際同行中的地位,有助于我國大麥產(chǎn)業(yè)的進(jìn)一步發(fā)展。